常绿乔木,株高可达50米。异叶南洋杉,树干高大,树形笔直,挺拔直通,极其壮观,树皮略呈灰色,裂成薄片,木质部和形成层中都含有树脂。异叶南洋杉,大枝横向平展伸开,有的长达10~15米,小枝平展或略为向下垂吊,形成宝塔形树冠,侧枝常成羽状排列,顶端向下垂。叶二型。幼枝及侧生小枝的针叶排列较为疏松,斜向展开,略向上翅,整个针叶油绿光亮,针叶上面具有多数的气孔线,表面有白粉,下面气孔线较细,或者没有气孔线。大树及花果枝上的针叶排列较密,微向斜展开,呈现宽卵形或三角状卯圆形。针叶上面具白粉和多条气孔线,下面气孔线较稀,雄球花单生枝顶,圆球形。果枝上的叶排列较密,球果硕大,近圆球形,苞鳞先端具有尖的三角形,种子椭圆形,两侧具有与苞鳞合生的宽翅。